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作者：冯玉飞;金珊;王玉冰;鲁印飞;庞丽娟;刘克坚;
单位：石河子大学第一附属医院心内一科;石河子大学医学院病理系;石河子大学第一附属医院病理科;广东省湛江市湛江中心人民医院病理科;
摘要：目的：筛选支架内再狭窄（ISR）中差异表达的免疫相关基因（DEIRGs），分析ISR中免疫细胞浸润情况，并阐明ISR发生发展的机制。方法：由基因表达数据库（GEO）下载GSE46560数据集样本mRNA基因表达数据，分为ISR组与非ISR(non-ISR)组。采用R软件“Limma”包筛选出差异表达基因（DEGs）并与免疫相关基因（IRGs）交集获得ISR中DEIRGs。采用R软件进行DEIRGs的基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析，采用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作（PPI）网络，以Cytoscape软件可视化并计算核心基因（Hub基因）。绘制Hub基因的受试者工作特征（ROC）曲线，计算ROC曲线下面积（AUC），并评价其诊断价值。采用CIBERSORT软件分析ISR中免疫细胞浸润情况，Pearson相关分析法分析免疫细胞间及其与关键基因之间的相关性。结果：共鉴定出331个DEGs(P<0.05，|log_2FC|>1)，其中176个基因表达上调，155个基因表达下调，获得38个DEIRGs。GO功能富集分析，在生物过程（BP）中DEIRGs主要富集在防御反应、免疫反应和免疫系统；在细胞组分（CC）中DEIRGs主要定位于胞外区和细胞质膜等；在分子功能（MF）中主要参与调控信号受体结合和细胞因子受体活性等。KEGG信号通路富集分析，ISR中DEIRGs主要富集于磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-AKT)和转化生长因子β(TGF-β)等信号通路。PPI网络，前10位Hub基因中CD19具有最高节点。与non-ISR组比较，ISR组样本中CD19 mRNA表达水平明显升高（P<0.05）。CD19 mRNA表达的ROC曲线中AUC值为0.92(P<0.05)。免疫细胞浸润分析，与non-ISR组比较，ISR组患者滤泡辅助性T淋巴细胞（Tfh）浸润水平升高（P<0.05），初始B淋巴细胞、 CD8+T淋巴细胞、幼稚CD4+T淋巴细胞和M0巨噬细胞等浸润水平升高，但差异无统计学意义（P>0.05），记忆性B淋巴细胞、活化性记忆CD4+T淋巴细胞、调节性T淋巴细胞、静息性自然杀伤（NK）细胞、活化性NK细胞、单核细胞、静息性肥大细胞和中性粒细胞等浸润水平降低，但差异无统计学意义（P>0.05）。Tfh与M0巨噬细胞和静息肥大细胞等呈正相关关系（r=0.88,P<0.05;r=0.68,P<0.05），与单核细胞和中性粒细胞呈负相关关系（r=-0.49,P<0.05;r=-0.42,P<0.05）。结论：CD19可能通过调控PI3K-AKT信号通路激活影响Tfh和B淋巴细胞，促进ISR的发生发展。CD19可作为诊断ISR的生物标志物。
关键词：支架内再狭窄;;CD19;;差异表达免疫相关基因;;免疫浸润;;生物标志物
基金资助：国家自然科学基金项目（82060054）;; 新疆生产建设兵团科技局财政科技计划项目（2020BC003）;; 广东省湛江市科技局科技发展基础研究专题专项（2022A01028）;广东省湛江市科技局疾病防治重点项目（2022A01103）;; 2022年度湛江中心人民医院院级高层次人才科研启动经费项目（2022A15,2022A16）;; 石河子大学科研项目（ZZZC202022A）;; 新疆维吾尔自治区研究生教育创新计划项目（XJ2022G110）;; 石河子大学第一附属医院博士基金项目（BS
