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作者：戴爱玲;张鑫杰;林楚云;尹会方;薛少华;刘建奎;杨小燕;
单位：龙岩学院生命科学学院;福建省生猪疫病防控工程技术研究中心;福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室;
摘要：为了了解2018—2020年福建地区猪瘟病毒流行及遗传变异情况，收集福建省不同地区临床发病猪的血液和肺脏、脾脏、淋巴结等组织样本1464份，采用RT-nPCR的方法对样品进行CSFV检测，对部分CSFV阳性样品E0基因进行克隆测序。结果显示，CSFV总体阳性率为1.9%(29/1464)，并获得13株CSFV E0基因序列。同源性分析发现所得13株CSFV E0基因之间的同源性在82.2%-99.7%，其中11株CSFV E0基因与1.1亚型代表毒株HCLV的核苷酸同源性为99.0%～99.9%，与Shimen株的核苷酸同源性94.1%～95.0%；1株与2.1c型参考毒株HNSD-2012核苷酸同源性为98.2%；1株与2.1d亚型毒株CSFV/JPN/2018核苷酸同源性为99.6%。遗传进化分析发现，10株CSFV与HCLV、C-ZJ-2008、Shimen和Brescia处于同一分支，属于1.1亚型；1株CSFV与HNSD-2012等位于同一分支，属于2.1c亚亚型；1株与CSFV/JPN/2018等位于同一分支，属于2.1d亚亚型。氨基酸序列分析发现，13株毒株与HCLV等代表毒株在重要的Rnase活性位点高度保守，其中2株2.1亚型毒株与HCLV毒株相比，其在第35位非关键氨基酸残基上发生由G→E的突变。结果表明福建地区CSFV流行情况趋向多样化，提示仍需加强对CSFV流行及遗传变异的持续监测，为猪瘟的诊断及有效防控奠定基础。
关键词：猪瘟病毒;;RT-nPCR;;E0基因;;遗传变异
基金资助：中央引导地方科技发展专项(2021L3028);; 福建省科技重大专项项目(2019NZ09005);; 龙岩市科技计划重大项目(2019LY1001);; 上杭县奇迈科技创新基金项目(2019SHQM06)
