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作者：赵婉宸;李扬;才天宇;葛志闯;高如一;王晓泉;顾敏;刘秀梵;
单位：扬州大学兽医学院农业农村部禽用生物制剂创制重点实验室;江苏省人兽共患病学重点实验室;江苏高校动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心;
摘要：H3亚型流感病毒在自然界广泛存在，可感染人、猪、马、犬、禽等众多宿主并能发生跨种间传播，危害不容忽视。本研究于2019—2021年在华东地区活禽市场采集表观健康的家禽喉头与泄殖腔棉拭，通过血清学试验鉴定、筛选出6株代表性水禽源H3亚型流感病毒，并经RT-PCR试验确定5株为H3N2亚型、1株为H3N1亚型。进一步对6株分离株进行全基因组测序、同源性比对和遗传进化分析，结果显示：HA蛋白裂解位点处均为PEKQTR/GLF，不存在连续碱性氨基酸，符合低致病性禽流感病毒的分子特征；受体结合位点处均为禽源特征性的226Q和228S，提示其跨种传播至哺乳动物的潜能较低；内部基因片段来源多样化，与H3N8、H4N6、H5N8、H6N1、H7N7、H0N3等众多亚型禽流感病毒的亲缘关系密切；除JS1018/19和JS1094/19的NS基因属于北美谱系以外，其余均属于欧亚谱系的禽源分支，与犬、马、猪、人等哺乳动物源毒株的亲缘关系较远，提示虽然可能存在不同进化谱系间的基因重组但并未发生从禽到哺乳动物宿主的基因交换。该研究结果丰富了H3亚型禽流感病毒的流行病学数据，为进一步了解我国低致病性禽流感病毒的分布特征提供了参考依据。
关键词：禽流感病毒;;H3N1;;H3N2;;基因组分析;;遗传进化
基金资助：国家自然科学基金项目(32072892);; 江苏省博士后科研资助计划(1501075C);; 现代农业产业技术体系专项(CARS-40);; 江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD);; 江苏高校“青蓝工程”;; 扬州大学“高端人才支持计划”
