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作者：齐昱;许丹;姜昊然;王雨琼;丽春;高树新;张文广;吴金山;
单位：内蒙古民族大学动物科技学院;内蒙古农业大学动物科学学院;呼伦贝尔市新巴尔虎右旗农牧业综合行政执法大队;
摘要：为了鉴定和分析蒙古牛抗寒过程中脂肪组织中发生的可变剪接(AS)事件，试验采用Illumina Novaseq~(TM) 6000平台对冬季组和夏季组蒙古牛的脂肪组织分别进行转录组测序，使用rMATS软件对样品中的AS事件与差异剪接基因(DSG)进行鉴定，并对DSG进行GO富集分析和KEGG信号通路分析。结果表明：转录组测序共获得263 312 598条原始读段，冬季组与夏季组中均发生AS事件数量分别为14 882,14 099个，两组AS事件都以外显子跳跃(SE)事件为主，SE事件在冬夏两组的AS事件总数中所占比例分别为80.90%、79.93%。冬季组与夏季组间共检测到1 436个显著的DSG。DSG分别在生物过程、细胞组分及分子功能类别中富集到了258,83,122个条目。DSG共在17条信号通路中发生富集，其中内吞作用、甘油磷脂代谢、PPAR信号通路、甘油酯代谢、脂肪酸降解、剪接体、RNA降解等信号通路富集明显。说明冬季组和夏季组蒙古牛脂肪组织可能在脂质代谢及RNA剪接和稳定性方面存在较大差异。
关键词：蒙古牛;;抗寒;;脂肪组织;;可变剪接;;差异剪接基因
基金资助：国家自然科学基金委员会专项(M2342001);; 内蒙古自然科学基金项目(2023LHMS03009);; 内蒙古自治区科技重大专项(2021ZD0009);; 内蒙古自治区直属高校基本科研业务费项目(GXKY23Z004);; 内蒙古民族大学博士科研启动基金项目(BS472)
