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中国畜牧杂志2025年第08期:基于全基因组关联分析挖掘大白猪乳头数性状关键候选基因

来源:期刊VIP网 时间:


作者:徐忠;李钰洁;周佳伟;张宇;李梓芃;冯越;陈通;陈大可;孙华;乔木;吴俊静;彭先文;梅书棋;

单位:动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北省农业科学院畜牧兽医研究所;

摘要:乳头数是母猪繁殖性能的重要指标,直接影响仔猪存活率和生产效益。本研究旨在通过全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study,GWAS)挖掘与美系大白猪乳头数性状相关的遗传标记及候选基因,为分子育种提供理论依据。以1 318头大白猪为研究对象,利用80K SNP芯片进行基因分型,采用MLM和FarmCPU模型筛选显著关联位点。结果显示,左、右及总乳头数的遗传力分别为0.351、0.308、0.41。利用MLM模型检测到影响大白猪左乳头数、右乳头数、总乳头数性状的显著位点分别为9、5、8个,注释到VRTN、ABCD4、LIN52和SYNDIG1L基因。利用FarmCPU模型,除以上4个基因外,还鉴定到MYOM3、VWA8和ZIC3等以前未被报道过的候选基因。本研究鉴定到的相关位点为大白猪乳头数的遗传改良提供了分子标记。

关键词:大白猪;;乳头数;;全基因组关联分析;;SNP;;候选基因

基金资助:湖北省重点研发计划项目(2023BBB105);; 国家生猪产业技术体系(CARS-35);; 湖北省农业科技创新中心创新团队项目(2025-620-000-001-014);; “尖刀”技术攻关项目(JD 2023027-02);; 湖北省科技创新团队项目