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作者：张新雨;吴俊静;乔木;徐忠;张宇;冯越;陈通;陈大可;李梓芃;彭先文;梅书棋;李凤娥;周佳伟;
单位：华中农业大学农业农村部猪遗传育种重点实验室农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室;动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室湖北省农业科学院畜牧兽医研究所;
摘要：本文旨在筛选SELENBP1基因中与猪肉质性状相关的分子标记，应用于猪肉质性状的遗传改良。本研究以硒都黑猪为研究对象，采用PCR扩增和Sanger测序法检测该基因启动子区的SNP位点，利用SPSS27.0软件分析SNP位点与猪肉质性状的关联性。结果显示：在硒都黑猪群体中SELENBP1基因的启动子区存在6个SNP，即rs327800463、rs338917833、rs330083802、rs329388255、rs343419358和rs338230265位点。其中，rs338917833和rs330083802与肌内脂肪含量显著相关；rs329388255、rs343419358和rs338230265与48 h滴水损失显著相关；rs327800463、rs338917833、rs329388255、rs343419358和rs338230265与系水力显著相关；rs338917833和rs330083802与肌肉色值L_1显著相关。单倍型分析发现6个SNP位点之间完全连锁，形成1个连锁块，共24种单倍型和35种单倍型组合。对数量最多的4种单倍型组合与猪肉质性状进行关联分析发现单倍型与猪肉肌内脂肪含量和肌肉色值L_1存在显著关联。此外，将与肌内脂肪含量相关的2个SNP位点突变前后的序列进行了转录因子预测，筛选到RXRA、PPARγ和POU2F2等潜在差异的转录因子。本研究结果将为猪肉质性状遗传改良提供分子标记。
关键词：猪;;SELENBP1;;单核苷酸多态性;;肉质性状;;单倍型
基金资助：国家自然科学基金项目(32102527);; 湖北省支持种业高质量发展资金项目(HBZY2023B006-05);; 湖北省重点研发计划项目(2023BBB105);; 国家生猪产业技术体系项目(CA RS-35);; 湖北省农业科技创新中心创新团队项目(2024-620-000-001-014)
