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作者：刘亚茹;孙超;于光辉;王源;
单位：青岛农业大学动物科技学院;济南市章丘区畜牧兽医事业发展中心;
摘要：为研究人工选育背景下大白猪群体的近交情况和鉴定与经济性状相关的功能基因，本研究采用猪80 K SNP芯片对323头大白猪进行基因分型，检测长纯合片段（Runs of Homozygosity,ROH）的长度、数量及分布，计算基于ROH的个体近交系数，并鉴定高频ROH区域的功能基因。结果显示，共检测到24 652个ROH，平均长度为5.91 Mb，个体平均近交系数为0.202。在大白猪群体中检测到11个高频ROH区域，分布在1、4、6、9及18号染色体上。将高频ROH区域与Ensembl数据库比对，鉴定到313个基因，其中，PTN、BCL2、PHPP1基因与生长发育相关；SETDB1、PMAIP1基因与繁殖相关；TNFAIP8L2、PSMB4基因与免疫相关。将高频ROH区域与猪QTL数据库进行对比，共得到656个重叠QTL，涉及肉质、生产、繁殖以及健康等性状。本研究结果揭示了目标群体的近交情况，并为大白猪生产性能和抗病力的提高提供了参考依据。
关键词：大白猪;;长纯合片段;;近交系数;;功能基因
基金资助：山东省重点研发计划项目(2022LZGC003、2024LZGC017);; 山东省自然科学基金项目(ZR2023QC059)
