来源：期刊VIP网 时间：
作者：王倩倩;吴燕;张游宇;顾丽菊;杨齐心;杨红文;肖礼华;张依裕;
单位：贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州大学香猪研究所;贵州省畜禽遗传资源管理站;贵州优农谷生态产业有限公司;遵义市畜牧渔业站;
摘要：本研究基于6只黑毛柯乐猪全基因组重测序对黑毛柯乐猪SNP和InDel突变位点进行挖掘并分析，对CDS区变异位点进行功能注释和通路分析。结果共检测到25 179 037个SNP和4 129 303个InDel,SNP和InDel变异位点主要分布于基因间隔区，其次是内含子区，而在CDS区的变异位点相对较少。对外显子区域的87 693个SNP和6 373个InDel变异位点进行GO和KEGG富集，发现诸多与免疫、代谢和感官等相关的基因，在KEGG通路中可发现多条与代谢、嗅觉信号和钙信号等相关的通路。本研究丰富了柯乐猪的遗传资源，为保护和开发柯乐猪提供了数据支持。
关键词：柯乐猪;;全基因组;;重测序;;SNP;;InDel
基金资助：贵州省生猪产业科技创新项目(黔农计财[2025]9号、黔农计财[2024]33号);; 贵州省生猪产业技术体系健康养殖功能实验室和遵义综合试验站建设项目(GZSZCYJSTX-03、GZSZCYJSTX-07);; 国家重点研发计划子课题(2022YFD11 00308-01);; 贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2021]5630号);; 贵州省科技支撑计划(黔科合支撑[2021]一般147)联合资助
