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作者:张开源;王畅;王冰洁;韩雪蕾;李新建;王腾飞;秦本源;李秀领;余彤;杨峰;柏峻;刘贤;
单位:河南农业大学动物科技学院;河南省畜牧技术推广总站;
摘要:中国本土猪种质资源正面临外来商品猪种基因渗透导致的遗传资源流失危机。作为河南省重新被发现的地方猪种资源,项城猪的种质特性与遗传背景亟待阐明。本研究通过线粒体DNA D-loop区测序技术对项城猪进行遗传多样性分析,并采用邻接法(Neighbor-Joining,NJ)构建其与6个国内外代表性猪种之间的系统进化关系。结果显示,项城猪群体遗传多样性较高,单倍型多样性(Haplotype Diversity,Hd)为0.833,核苷酸多样性(Nucleotide Diversity,Pi)为0.003 11,其遗传多样性水平高于淮南猪(Hd=0.788,Pi=0.00156)、藏猪(Hd=0.705,Pi=0.002 83)、莱芜猪(Hd=0.589, Pi=0.002 46),与南阳黑猪(Hd=0.815,Pi=0.003 60)、五指山猪(Hd=0.838,Pi=0.003 34)和保山猪(Hd=0.828,Pi=0.003 71)等处于相近水平。项城猪群体共鉴定出14个单倍型,涉及29个多态位点(21个单一变异位点,8个简约信息位点)。其中,项城猪公猪群体展现出更高的单倍型分化(11个单倍型,21个多态位点),表明其公猪群体在维持群体遗传结构中可能发挥重要作用。系统进化树分析显示,项城猪形成一个独立分支,其与河南地方猪种间的遗传距离(Genetic Distance,GD)较近(GD为0.004~0.010),但仍存在一定差异;项城猪与西方外来猪种杜洛克、长白猪之间的遗传距离更远(GD为0.022~0.024),进一步说明项城猪的地方独立性。本研究首次系统揭示了项城猪独特的遗传结构和丰富的遗传多样性,研究成果为项城猪的遗传保护、资源评价及种质创新利用提供了坚实的分子遗传学基础。
关键词:项城猪;;线粒体DNA;;D-loop区;;遗传多样性;;系统发育分析;;遗传距离
基金资助:河南省现代农业产业技术体系生猪产业技术体系项目(HARS-22-12-G4);; 河南新郑生猪科技小院