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中国兽医科学2026年第04期:羊肠道病毒流行病学调查及全基因组序列分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:王祎祺;李霞;周俊明;李彬;贡嘎;毛立;

单位:西藏农牧大学动物科学学院;江苏省农业科学院兽医研究所/农业农村部兽用生物制品工程技术重点实验室;

摘要:羊肠道病毒(CEV)是导致羊腹泻疾病的重要病原之一,为了解CEV毒株的流行特点,于2023年采集了江苏省三地市78份山羊粪便样品并进行了RT-PCR检测。结果显示,江苏省不同地区均存在CEV感染,检测出阳性样本30份,各地区阳性率为14.29%~81.81%,总阳性率为38.46%。从山羊样品中分离到CEV毒株1株,将其命名为XY2302株,通过RT-PCR、IFA、电镜观察、高通量测序等方法分析该病毒特征。结果显示,该毒株接种MDBK细胞后可观察到明显的细胞病变,IFA鉴定可见特异荧光,电镜观察到直径20~30 nm的无囊膜病毒颗粒,具有典型的肠道病毒形态学特征。同源性分析显示,分离毒株的全基因组、5′-UTR、VP1和2AB与参考毒株的同源性分别为73.4%~79.2%、80.2%~93.4%、66.9%~100.0%和26.6%~64.1%。遗传进化分析显示分离株与EV-G5代表毒株位于同一分支,亲缘性较高,其中VP1序列与EV-G5毒株的同源性最高,为100%。2AB序列与其他参考序列差异较大,在进化树中形成独立分支。研究表明,CEV在江苏地区山羊中仍然具有较高的阳性率,毒株基因组序列存在一定变异,丰富了国内CEV病原学与遗传进化数据,为该病毒流行病学、遗传演化分析提供了基础资料。

关键词:羊肠道病毒;;流行病学调查;;分离鉴定;;遗传进化分析

基金资助:国家重点研发计划项目(2023YFD1801302);; 江苏省重点研发计划项目(BE2022330)