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作者:党悦旖;田澍瑶;潘娟娟;张磊;吴桂灵;贾陈阳;罗生金;佟盼盼;谢金鑫;
单位:新疆农业大学动物医学学院;阿克苏动物疫病控制诊断中心;新疆医科大学核酸检测中心;哈密畜牧工作站;中国农业科学院西部农业研究中心;
摘要:为调查人乳头瘤病毒23型(HPV-23)的宿主感染情况,根据GenBank中HPV-23相对保守的E2基因序列,设计1对特异性引物和1条TaqMan探针,通过优化反应条件,建立了用于检测HPV-23的TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法。结果显示,该方法特异性好,除HPV-23检测出现特异性曲线外,其他病毒均未出现特异性曲线;灵敏度高,最低检测限为10拷贝/μL,敏感性高于常规PCR 1000倍;重复性高,批内和批间试验的变异系数均小于2%。对临床样品进行检测,该荧光定量PCR方法检测阳性率显著高于常规PCR(P<0.05)。本研究首次建立了HPV-23 TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法,具有特异性好、敏感性高、重复性高的优点,可用于HPV-23的分子流行病学调查。
关键词:人乳头瘤病毒23型;;E2基因;;TaqMan-MGB探针;;实时荧光定量PCR
基金资助:中国博士后科学基金项目(2020T130555);; 国家自然科学基金地区基金项目(32060808);; 新疆自然科学基金杰青项目(2022JQ0283);; 中央引导地方科技发展专项资金项目(ZYYD2023C03)