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作者:郁丽琴;韩坤;陈汉;王瑞晨;张术斌;马江涛;殷启凯;崔倩倩;聂凯;付士红;李樊;王环宇;许松涛;
单位:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室;宁夏回族自治区疾病预防控制中心宁夏回族自治区预防医学科学院;
摘要:为了调查宁夏地区蚊虫携带主要蚊媒病毒的种类及其流行情况,本研究于2023年在宁夏采集蚊虫样本,采用实时荧光定量逆转录PCR(Reverse transcription-quantitative real-time PCR, RT-qPCR)筛查6种蚊媒病毒核酸,包括塔希纳病毒(Tahyna virus, TAHV)、乙脑病毒(Japanese encephalitis virus, JEV)、辛德毕斯病毒(Sindbis virus,SINV)、西尼罗病毒(West Nile virus, WNV)、库蚊黄病毒(Culex flavivirus, CxFV)和盖塔病毒(Getah virus,GETV)。对阳性样本进行病毒基因扩增、序列测定及系统进化分析。结果共采集5540只蚊虫标本,包含伊蚊、按蚊和库蚊,其中伊蚊数量最多为3350只(60.47%)。按采集时间、地点和蚊种共分装为185批标本。RT-qPCR检测结果显示,1批蚊虫JEV阳性,1批蚊虫TAHV阳性,55批蚊虫CxFv阳性。经Sanger测序获得1株TAHV的S、M和L段基因序列,长度分别为767 nt、3836 nt、6814 nt。1株JEV全基因组序列,长度为10967 nt。36株CxFv E基因序列,长度约为1450 nt。同源性及系统发育分析结果显示,新测序的TAHV S、M、L段基因序列分别与内蒙古分离株HQ541823.1、盘锦分离株OP727995.1和捷克斯洛伐克分离株KF361881.1亲缘关系最近,核苷酸(氨基酸)相似性分别为99.29%(100%)、94.76%(98.47%)、95.22%(99.25%);新测序的JEV全基因组序列与2020年四川毒株JEV-SC-2020-1亲缘关系较近,核苷酸(氨基酸)相似性为99.83%(99.97%),同属于GIb型;2批CxFv(NX23176、NX23182)属于GIB型,34批CxFv属于GIA型。本研究于2023年在宁夏采集的蚊虫中检测到3种蚊媒病毒,并首次在宁夏获得1株TAHV S、M、L段完整编码区基因组序列,为当地蚊媒病毒监测和防控提供了重要的基础数据。
关键词:宁夏回族自治区;塔希纳病毒;乙脑病毒;库蚊黄病毒;盖塔病毒
基金资助:国家重点研发计划资助(项目号:2022YFC2302700),题目:跨境虫媒传染病防控病原监控体系研究与口岸应用~~