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作者：吴芸;李盼盼;闫吉美;杨凤;黄锡阳;
单位：遵义师范学院生物与农业科技学院;赤水市农业农村局畜牧渔业站;
摘要：为探究赤水乌骨鸡线粒体DNA控制区的遗传多样性、单倍型特征和母系起源情况，利用PCR扩增和直接测序法检测了63只赤水乌骨鸡线粒体DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)控制区（D-loop）全序列，分析其遗传多样性和单倍型特性，并与不同红色原鸡亚种的序列进行聚类分析。结果表明，赤水乌骨鸡mtDNA D-loop区全序列共检测到29个突变位点，构成19种单倍型。遗传多样性分析表明，单倍型多样性（Hd）、核苷酸多样性（Pi）和平均核苷酸差异数（K）分别为0.990 5±0.018 0、0.006 5±0.000 5和7.981。系统发育分析显示，赤水乌骨鸡19种单倍型可划分为A、B、C、E、G 5个单倍型群，A、B均分别与原鸡滇南亚种聚类，单倍型群C与原鸡印度亚种、原鸡滇南亚种和原鸡海南亚种聚为一类，E单倍型群分支与印度亚种和原鸡滇南亚种聚为一类。据此推测，赤水乌骨鸡遗传多样性丰富，可能有多个母系起源，主要源于原鸡滇南亚种。
关键词：赤水乌骨鸡;mtDNA;控制区;遗传多样性;系统进化
基金资助：遵义师范学院“乡村振兴专项”项目（黔教合KY字[2012]017-17号）
