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作者:谷博;杨一;邓祎婕;孟新超;姜怀志;
单位:吉林师范大学生命科学学院;吉林农业大学动物科学技术学院;
摘要:本研究通过构建及分析2、6、12月龄小尾寒羊卵巢组织miRNA表达谱,鉴定了不同发育阶段差异表达的miRNAs,并对其进行靶基因预测。结果显示,2月龄vs 6月龄、6月龄vs 12月龄及2月龄vs 12月龄分别筛选出11个、13个及19个差异表达的miRNA,同时分别预测到靶基因54、37、198个。进而对这些靶基因进行功能注释及信号通路分析,发现2月龄vs 6月龄差异表达miRNA靶基因主要参与酮的生物合成、铁离子跨膜转运等生物功能及核苷酸剪切修复、Hippo等信号通路;6月龄vs 12月龄差异表达miRNA靶基因主要参与tRNA氨酰化、葡萄糖运输等生物过程及TGF-β、卵母细胞减数分裂等信号通路;2月龄vs 12月龄差异表达miRNA靶基因富集到多细胞生物过程、碱基生物合成等生物过程及卵母细胞成熟、Rap1等信号通路。采用qRT-PCR方法对随机选取的9个差异表达miRNA进行验证,结果证实了RNA-seq测序的准确性。本研究结果为阐明绵羊卵巢发育的分子调控机制提供了重要理论依据,同时为后续绵羊卵巢miRNA研究提供了基础资料。
关键词:小尾寒羊;卵巢发育;miRNA;靶基因预测
基金资助:吉林省科技发展计划(20210101049JC)