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作者：杨祎挺;甘麦邻;刘成铭;郝紫玲;杜勇;程文强;李平华;沈林園;朱砺;
单位：四川农业大学猪禽种业全国重点实验室;四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室;全国畜牧总站;南充职业技术学院;
摘要：本试验旨在研究藏猪4个类群的全线粒体基因组的群体多样性与系统发育关系。研究共收集120头分布在4个地区的藏猪进行重测序，组装线粒体基因组并对其进行分析。结果表明：西藏藏猪拥有相对高的遗传多样性（Pi=0.00111）；四川藏猪与西藏藏猪的遗传距离相对更近（0.045）。构建系统发育树发现，甘肃藏猪与云南藏猪群体内部相对独立。单倍型分析发现4个藏猪群体存在27个单倍型，西藏藏猪拥有高于其他群体的单倍型分布（12/27）。综上所述，4个地理分布不同的藏猪群体全线粒体基因组存在差异，甘肃藏猪与云南藏猪的系统发育关系揭示了群体内部可能存在近交进而导致遗传距离降低。本研究为进一步更新藏猪类群遗传多样性与遗传结构提供了理论支持，并为藏猪的保种与利用奠定了基础。
关键词：藏猪;线粒体基因组;群体多样性;系统发育树;单倍型分析
基金资助：四川省科技计划（2021YFYZ0007、sccxtd-2023-08-09）; 财政部和农业农村部：现代农业产业技术体系（CARS-35）; 国家生猪技术创新中心（NCTIP-XD/C13）
