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作者：张瑜;田佺;郭亚洲;周育臻;杜娟;任建存;
单位：杨凌职业技术学院;四川省龙日种畜场;
摘要：试验旨在研究热应激（HS）条件下努比亚山羊与湖羊的肌肉生长发育相关的差异表达基因（DEGs）及通路的异同。采用转录组测序（RNA-Seq）分别对努比亚山羊和湖羊的肌肉进行测序，对比分析RNA-Seq结果的异同。结果显示，山羊组共检测到20 587个基因，筛选出95个DEGs，包括34个上调基因和61个下调基因。湖羊组测序共鉴定到14 685个基因，筛选出180个DEGs，包括71个上调基因和109个下调基因。GO功能富集分析显示，HS显著影响山羊组509个功能类别，DEGs主要参与结合、生物系统调节、免疫系统等相关功能；HS显著影响湖羊组731个功能类别，DEGs主要参与结合、蛋白活性、细胞外基质等相关功能。KEGG通路富集分析显示，山羊组共涉及156个通路，DEGs主要富集在细胞黏附分子、MAPK信号通路、磷脂酶D信号通路和黏着斑等信号通路，进一步从中筛选出可能参与肌肉发育的5个DEGs:MET原癌基因受体型酪氨酸激酶（MET）、丝裂原活化蛋白激酶10 (MAPK10)、成纤维细胞生长因子1 (FGF1)、磷脂酶A2组IVE (PLA2G4E)、双特异性磷酸酶1(DUSP1)；湖羊组DEGs共涉及164个通路，DEGs显著富集在钙信号通路、ECM-受体相互作用、PPAR信号通路和黏着斑等信号通路，筛选出与肌肉发育相关的7个DEGs：软骨黏附素（CHAD）、P-选择素前体（SELP）、Ⅰ型胶原蛋白α1链（COL1A1）、Ⅰ型胶原蛋白α2链（COL1A2）、Ⅵ型胶原蛋白α6链（COL6A6）、整合素-11(ITGA11)、前列腺素F受体（PTGFR）。研究表明，HS影响努比亚山羊和湖羊肌肉生长发育的主要通路不同，参与的调控基因不同，黏着斑是HS影响山羊和湖羊的肌肉生长发育的共同通路。
关键词：热应激;;努比亚山羊;;湖羊;;肌肉生长发育;;转录组
基金资助：杨凌职业技术学院2023年校内基金（项目编号：ZK23-12）
