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作者：曾德平;陆颖;余科辰;卢峥朴;柏家果;秦秋英;隆美金;陈樱;韦祖樟;黄伟坚;欧阳康;
单位：广西大学动物科学技术学院广西高校动物疫病预防与控制重点实验室;广西壮族自治区兽用生物制品工程研究中心;广西畜禽繁育与疾病防控重点实验室;
摘要：猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染仔猪可引起严重腹泻，导致肠道黏膜损伤、免疫功能低下。为探究PEDV感染仔猪空肠基因组转录水平的变化，筛选宿主免疫应答的差异表达基因，本研究收集PEDV感染仔猪的空肠组织，利用RNA-Seq技术进行转录组学测序分析。RNA-seq结果显示，与正常未感染仔猪相比，PEDV感染仔猪存在339个显著差异表达基因(DEGs)，其中182个上调基因，157个下调基因。GO分子功能结果显示，免疫相关差异表达基因主要与免疫球蛋白和受体结合、T细胞增殖等有关。KEGG通路富集结果显示，差异表达基因主要涉及TNF信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、Janus激酶/信号转导与转录激活子信号通路以及RIG-I受体信号通路等；最后再利用qRT-PCR对差异表达基因进行验证，其结果与转录组学结果基本一致。本研究为进一步研究PEDV感染导致宿主免疫应答变化机制提供了科学依据。
关键词：猪流行性腹泻病毒;;转录组分析;;差异表达;;RNA-Seq;;先天免疫
基金资助：广西自然科学基金资助项目(2021GXNSFAA196067);; 大学生创新创业训练计划项目(202210593870)
