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中国动物传染病学报2025年第02期:动物源大肠杆菌MALDI-TOF MS质谱库的建立及在北京地区区域性差异应用分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:张启龙;钱云开;刘利勤;傅彩霞;贾宏丽;刘海莹;栗云鹏;杨逸舟;田辉;董志军;朱家强;周德刚;

单位:北京市动物疫病预防控制中心;秦皇岛海关技术中心;北京鑫汇普瑞科技发展有限公司;

摘要:为比较不同区域大肠杆菌是否具有差异性,本研究针对自北京市怀柔区收集分离的11株大肠杆菌和延庆区收集分离的22株大肠杆菌进行了鉴定,分别采用常规生化法、16S rRNA测序和基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)的鉴定方法进行鉴定,比较了3种方法鉴定的准确率,并对获得的细菌肽质量指纹谱数据进行分析。结果显示:两地采集的大肠杆菌用3种方法鉴定,其准确性都在95%以上,其中MALDI-TOF MS鉴定采用多点点靶时准确率可达99%以上,多点点靶下MALDI-TOF MS鉴定重复性强、准确高、时间快;不同区域的大肠杆菌虽具有相似的肽质量指纹谱特征,但聚类分析和主成分分析显示所有数据可清晰地按地区聚成两簇,其中怀柔一簇、延庆一簇,两簇之间区分明显。表明自怀柔和延庆采集的大肠杆菌的肽质量指纹谱具有区域性差异,可为基于MALDI-TOF MS的大肠杆菌溯源性分析提供技术依据。

关键词:大肠杆菌;;MALDI-TOF MS;;肽质量指纹谱;;北京

基金资助:北京市农业农村局科技项目(20190117);; 海关总署科研项目(2020HK229)