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作者：刘蓬;郝洋洋;梅艳芳;许秀华;陶智博;向天新;刘洋;魏丹丹;
单位：南昌大学第一附属医院检验中心;南昌大学第一附属医院江西省重大公共卫生事件医学中心;
摘要：目的 分析1例患者同时从血液及腹腔中分离到的O1群霍乱弧菌非产毒株(HL01和HL02)的基因组特征。方法 2024年7月，在南昌大学第一附属医院感染科病房的1例老年患者的血液和腹水中分离出霍乱弧菌菌株(HL01、HL02)。使用全自动药敏分析仪测定菌株的抗菌药物敏感性，使用二代基因测序获得菌株的完整基因组序列，使用BLAST在线比对与综合抗生素抗性数据库、耐药基因预测数据库Resfinder等数据库进行比对分析，明确菌株携带的耐药基因、毒力基因等。基于基因组单核苷酸多样性，使用jolytree构建系统发育树，中值法定根。使用fastANI分别计算HL01和HL02与这146个基因组的核苷酸进行基因组相似性比对。结果 两株均为O1群非产毒霍乱弧菌，多位点序列分型(MLST)为ST167型，携带了多个毒力相关基因，该菌对头孢唑林和多黏菌素耐药。结合基因组进化关系发现，菌株间携带耐药基因和耐药质粒的情况呈现出一定聚集性。菌株HL01和HL02的传统ST型为ST167,cgMLST型为与cgMLST-960最接近的新型别，两株菌基因组高度同源。系统发育树表明两株霍乱弧菌与从水生环境中分离的霍乱弧菌菌株密切相关。结论 HL01和HL02虽不携带ctxAB毒力基因，但存在多种毒力因子致病，因此需对肠道外分离的O1/O139霍乱弧菌进行持续监测，全基因组分析是必要的。
关键词：血流感染;;O1群;;非产毒;;霍乱弧菌;;全基因组
基金资助：国家自然科学基因地区基金项目(82260403);; 江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ200148);; 江西省卫健委科技计划项目(202210345);; 江西省中医药科技计划项目(2022B829)
