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作者:金丁萍;陆群;周宏伟;周哲敏;杨晓煊;吴飞宇;胡燕燕;
单位:浙江大学医学院附属第二医院感染管理科;浙江大学医学院附属第二医院检验科;苏州大学医学院附属第二医院癌症研究院;
摘要:目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)在三个重症监护室(ICU)环境耐药菌监测中的应用价值,揭示耐药菌传播特征,为优化感染控制提供依据。方法 选取某三级甲等综合性医院外科重症监护室(SICU)、急诊重症监护室(EICU)和脑科重症监护室(NICU)的物表及空气样本,结合常规细菌培养与mNGS技术,分析微生物群落、耐药基因和毒力因子分布,并通过系统发育树和冗余分析(RDA)探究传播路径。结果 培养结果显示,3个ICU物表均检出耐药菌,主要为携带OXA-23型碳青霉烯酶的不动杆菌、携带KPC型碳青霉烯酶的肠杆菌目细菌和假单胞菌。空气样本仅NICU检出耐药菌,主要为利奈唑胺耐药葡萄球菌。mNGS揭示环境中存在复杂细菌群落,其中NICU物表样本多样性最高,并检出与全球流行一致的IC2型鲍曼不动杆菌。RDA显示,不同ICU的物表与空气样本群落差异显著。耐药基因和毒力基因分析显示,SICU物表样本携带多种β-内酰胺酶基因及铁摄取相关毒力基因,NICU样本则富集鲍曼不动杆菌菌毛合成相关毒力基因;空气样本中仅NICU检出携带bla_(OXA)、bla_(KPC)和bla_(SHV)的耐药菌。结论 mNGS可精准识别ICU环境耐药菌的分布特征及潜在传播关联,与常规培养形成互补。其应用有助于建立ICU环境耐药菌的主动监测体系,提高院感防控的精准性和时效性。
关键词:重症监护室;;耐药菌;;宏基因组二代测序;;细菌培养;;院感防控
基金资助:浙江省自然科学基金探索项目(LMS25H200003)