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作者：刘健;孙盛;桂亚萍;夏琦琦;杨显超;夏炉明;郁达义;孙清;王建;刘佩红;赵洪进;
单位：上海市动物疫病预防控制中心;中国农业科学院长春兽医研究所;上海市闵行区动物疫病预防控制中心;上海市农业科学院;
摘要：为了解上海地区犬狂犬病病毒（Rabies virus,RABV）流行株G基因遗传进化情况，分析G蛋白生物信息学特征，应用RABV直接免疫荧光法（DFA）对上海地区不同年份的犬脑组织样本进行鉴定，阳性样本进行G基因测序和遗传进化分析，并用生物信息软件对G蛋白结构功能进行分析。结果显示分离株G基因全长为1 575 nt，编码524 aa，与国内参考株G基因核苷酸和氨基酸序列相似性分别为82.8%～99.9%和89.5%～99.8%；遗传进化分析显示分离株处于RABV China Ⅰ群的不同分支；G蛋白抗原位点关键氨基酸均未发生变化；蛋白结构和功能预测显示G蛋白属于弱碱性、稳定的亲水性蛋白，二级结构以无规则卷曲占比最高，其次为β-折叠，最后为α-螺旋，分离株在跨膜区、膜内区与疫苗株存在差异，在膜外区（抗原位点区）具有较好的一致性；分离株保留了338位糖基化位点，但糖基化位点数少于疫苗株。研究表明上海地区RABV是由于人类活动引起的犬的远距离移动或跨省流动而造成的RABV局部的传播和流行；分离株G蛋白非重组载体疫苗首选的靶蛋白。本研究为RABV防控策略的制定提供了理论支持，也为重组载体狂犬病口服疫苗的设计和毒株的筛选提供了实验依据。
关键词：狂犬病病毒;;G基因;;遗传进化分析;;生物信息学分析
基金资助：上海市农业科技创新项目（项目号：沪农科[（T2024210）],题目：基于智能终端的流浪犬猫狂犬病口服疫苗免疫关键技术研究（青年项目）~~
