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作者:郭景霞;何尧;郭艳;赵湾文槿;李永鑫;李凡卡;
单位:新疆生产建设兵团疾病预防控制中心;新疆生产建设兵团医院石河子大学医学院第二附属医院;兵团医学检验临床医学研究中心;
摘要:分析新疆生产建设兵团(简称新疆兵团)2022-2024年甲型H3N2流感病毒抗原性变异及耐药情况。本文采集哨点医院流感样病例咽拭子标本进行病毒分离,选取病毒血凝效价≥8的毒株,利用二代测序技术对病毒株进行全基因组测序后通过生物信息学软件MEGA分析基因进化特征,同时分析病毒HA抗原决定簇和NA基因氨基酸位点变化情况,对其进行基因进化同源性和三维建模分析。新疆兵团2022-2024年甲型H3N2亚型流感病毒株均位于3C.2a1b.2a.2a.3a.1分支,与WHO 2022-2023年发布的疫苗株A/Darwin/6/2021亲缘关系较近,HA基因抗原决定簇上存在9处不同的氨基酸突变位点。NA基因共存在27个氨基酸突变位点,但是均不在NA酶活性位点,推测不会产生相关的耐药性。全基因组其余6个片段序列相似性为95.2%~100%,均位于相应分支无重配现象。2022-2024年度新疆兵团H3N2亚型流感病毒与WHO 2022-2023年发布的疫苗株对比发生了部分变异,还需持续做好流感病毒抗原性和耐药监测工作,及时掌握流感病毒基因特性情况,为本地区流感病毒防控提供科学依据。
关键词:甲型H3N2亚型流感病毒;;全基因组测序;;同源性;;糖基化;;三维建模
基金资助:国家临床重点专科建设项目:(项目号:兵财社[2023]16号);; 兵团临床医学研究中心建设项目:(项目号:兵科发[2023]12号);; 兵团重点领域科技攻关计划项目:(项目号:2022AB027)题目:基于环介导等温扩增技术的呼吸道病毒核酸快速检测技术的研发~~