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作者：王鑫康;聂丽娜;李艳;肖敏敏;杨竹;
单位：皖南医学院临床医学院;华东师范大学附属芜湖医院(芜湖市第二人民医院)检验科;安庆市第一人民医院输血科;皖南医学院研究生学院;皖南医学院基础医学院;
摘要：探究本地区人冠状病毒HKU1的基因特征并研究其进化关系。对2020年7月-2021年12月芜湖市第二人民医院发热门诊采集成人急性上呼吸道感染患者咽拭子标本进行RNA提取及实时荧光RT-PCR检测，并通过逆转录-链式聚合酶反应（RT-PCR）对HCoV-HKU1 RNA依赖的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA-Polymerase,RdRp）、刺突蛋白（Spike, S）、核衣壳蛋白（Nucleocapsid, N）3个靶基因进行基因扩增及序列测定；GenBank下载51株代表性HCoV-HKU1全基因组序列，分别用获得的RdRp、S、N核苷酸序列构建分析集并进行基因亲缘性关系树分析；最后基于HCoV-HKU1不同基因型对S基因片段进行氨基酸位点变异分析。本研究共收集701例样本，并成功检出6例HCoV-HKU1阳性样本，感染率为0.86%(6/701)；基因亲缘性关系树分析结果显示，3株HCoV-HKU1样本被鉴定为A基因型（202007032、202008190、202008324）,3株样本属于B基因型（202008180、202101291、202101280）；此外，S基因氨基酸位点变异分析表明，A、B、C不同基因型存在特异性变异位点，而247-249号氨基酸位点变异可能是影响B基因型转化为C基因型的关键因素。本研究基于RdRp、S和N基因序列分析其基因型及S基因氨基酸位点变异特点，丰富了我国HCoV-HKU1基础研究数据。
关键词：人冠状病毒HKU1;;基因特征;;基因型;;流行病学
基金资助：安徽省危重症呼吸疾病临床医学研究中心开放课题（项目号：WK2023LC04）,题目：新冠病毒及流感病毒快速可视化检测技术的研发与应用;; 安徽省大学生创新创业训练计划项目（项目号：S202310368013）,题目：新冠疫苗接种对普通冠状病毒流行病学影响的研究~~
