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作者:付小强;孙强;徐惠;董江峰;秦艺;方斌;
单位:鄂州市疾病预防控制中心;湖北省疾病预防控制中心;
摘要:为了解2024年鄂州市城乡活禽市场H9N2亚型禽流感病毒的遗传变异特征及进化规律,本研究采集活禽市场外环境标本,开展H9N2亚型禽流感病毒核酸检测,对阳性标本进行病毒分离,并测定分离毒株的HA和NA基因序列,运用生物信息学软件分析其基因特征。系统进化树和核苷酸相似性分析表明,2株分离株的HA和NA基因分别归属于h9.4.2.5c分支和1.2分支,与早期毒株的核苷酸相似性分别为85.57%~91.83%和85.51%~89.29%。氨基酸序列关键位点分析发现,HA蛋白裂解位点为PSRSSR↓GLF,表明其属于低致病性禽流感病毒,且受体结合位点出现T155N、S158N、F/A160N等突变;NA蛋白茎部缺失63~65位的3个氨基酸(TEI),红细胞366-373结合位点发生K/E/S368N、D369N突变,而与NA蛋白耐药性相关的位点未发生突变。进化速率估算结果显示,HA基因平均进化速率为2.479×10~(-3)替代/位点/年,NA基因平均进化速率为1.573×10~(-3)替代/位点/年,其最近共同祖先估算时间分别在2003年和2009年,说明HA基因比NA基因进化更为活跃。研究结果提示,2024年从鄂州市城乡活禽市场外环境分离的H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因检测到部分关键位点突变,这些突变可能增强了病毒对哺乳动物的适应性,在进化过程中存在潜在的跨宿主传播风险,需持续加强对该病毒分子进化的监测,以便评估其公共卫生威胁,为防控策略的制定提供科学依据。
关键词:城乡活禽市场;;H9N2;;禽流感病毒;;HA基因;;NA基因;;生物学特征
基金资助:2023年鄂州市科技计划项目(EZ01-007-20230021),题目:鄂州市外环境禽流感病毒污染情况及职业暴露人群血清学研究~~