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作者：杨旭;何敏;董晓庆;董潇潇;闵小雨;王子彧;丁洁;
单位：南京医科大学附属南京疾病预防控制中心;南京医科大学公共卫生学院;
摘要：本研究旨在分析南京及周边地区2020-2024年发热伴血小板减少综合征病毒（Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV）的基因型分布、系统进化特征及关键氨基酸突变情况，为该地区SFTS的病原学研究和防控策略提供科学依据。研究共收集2020-2024年确诊SFTS病例的血清样本67例，提取病毒RNA并采用高通量测序技术获取SFTSV全基因组序列。通过MEGA5.2软件进行序列比对，基于IQ-TREE 2.3.6构建系统发育树，并开展单倍型网络分析、重组分析、选择压力分析及氨基酸突变位点分析。共获得58株全基因组序列，涵盖A、B、D、E、F五个基因型，其中A型（36.21%）和F型（41.38%）为主要流行型别。A、D、E型主要分布于南京市，F型则广泛分布于南京及其周边地区，不同年份间基因型分布无显著差异。系统发育分析显示，病毒在不同片段间基因型分布一致，未发现明显的片段重排或基因重组事件。选择压力分析结果表明，RdRp、GP、NSs和NP等结构与非结构蛋白编码区均处于强烈负选择状态，仅RdRp区域第2位氨基酸残基存在阳性选择位点。多种关键氨基酸突变位点（如GP区的R624K、V323I和M491I）可能与病毒适应性和毒力增强相关。综上所述，南京及周边地区流行的SFTSV基因型分布较为稳定，病毒进化较为保守，部分特征性突变的出现提示其可能在病毒传播与致病机制中发挥重要作用，为深入理解SFTSV的分子演化及制定防控策略提供了重要参考。
关键词：发热伴血小板减少综合征病毒;;系统进化分析;;重组分析;;选择压力;;氨基酸突变
基金资助：南京科技重大专项（2021-11005）,题目：南京市重大传染病早期预警及精准防控关键技术研究;; 南京医科大学南京公共卫生研究院研创新项目（NCX2303）,题目：发热伴血小板减少综合征流行病学特征及重症感染的生物标志研究;; 南京市公共卫生检验检测重点实验室基金项目（宁卫财务（2023）81号）~~
