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作者：陈泰然;李珊珊;白萨茹拉;郭刚;王雅春;
单位：中国农业大学动物科学技术学院;北京首农畜牧发展有限公司;
摘要：近交是影响家畜遗传多样性和种群健康的关键因素之一，尤其在高产奶牛群体中，近交可能导致生产性能下降和繁殖力减弱。本研究旨在通过近交系数来反映北京地区3个主要奶牛场的荷斯坦牛群体近交状况，对比分析基于系谱信息和SNP芯片数据2种方法计算近交系数，计算个体基于系谱的近交系数（F_(PED)）和基于连续纯合片段（Runs of Homozygosity,ROH）的近交系数（F_(ROH)），随后对高频ROH区域进行基因注释并鉴定候选基因。结果表明：平均F_(ROH)为0.106 2，波动范围在0.000 6～0.401 6之间；平均F_(PED)为0.025，波动范围在0～0.292 6之间。鉴定到来自8个高频ROH区域的63个与奶牛经济性状相关的基因，如与牛乳脂量相关的基因ABCG2和SCD，与牛生长发育相关的基因NCAPG和PAX2。本研究对改善奶牛的遗传管理和育种规划具有重要意义。
关键词：连续纯合片段(ROH);近交系数;荷斯坦牛;候选基因
基金资助：宁夏回族自治区重点研发项目（2023BCF01004）; 青海省重大科技专项（2021-NK-A5）; 河南省重点研发专项;河南省重点研发专项（221111111100）; 国家现代农业产业技术体系（CARS-36）; 长江学者和创新团队发展计划（IRT＿15R62）
