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作者：李何君;张彩云;李拓芜;马裴裴;吴昊旻;徐忠惠;陆雪林;
单位：上海农林职业技术学院;上海交通大学农业与生物学院;上海市动物疫病预防控制中心;上海市崇明区种畜场;
摘要：本文旨在通过全基因组关联分析方法鉴定与沙乌头猪生长发育及繁殖性状相关的基因。本研究数据来自沙乌头猪保种场2019年采集的26头生产公猪和207头生产母猪，采集耳组织样后，利用中芯一号基因芯片进行检测，经过填充及质控后，使用主成分分析方法检验群体分层情况。同时测定这些猪的生长发育及繁殖数据，包括6月龄体重、体长、胸围、体高、胸深及总产仔数、产活仔数、死胎数、初生窝重、断奶仔猪数和断奶窝重，使用混合线性模型对这些性状分别进行全基因组关联分析。结果表明，沙乌头猪群体内无明显分层。全基因组关联分析方法鉴定到影响产活仔数的单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP）位点共计11个，与初生窝重、体重、胸围显著关联的SNP分别为7、1、1个。为查找关联基因，检测了显著位点上下游100 kb的区段，除产活仔数以外，其他性状均未找到关联基因。与产活仔数关联的基因共计19个，其中CRABP2、STON1、KCNK12、MSH2、VANGL2 5个基因前期被报道与繁殖性状有关，这些基因可作为与沙乌头猪产活仔数关联的候选基因，后续可通过试验进一步验证。本研究为沙乌头猪生长发育及繁殖性状的遗传机制解析提供了理论依据。
关键词：沙乌头猪;生长发育性状;繁殖性状;全基因组关联分析
基金资助：中青年教师领军人才培养计划（A6-02RS-23-28）; 科技支撑计划（2008BAC13B08）; 国家科技基础条件平台项目（2008DKA28801）; 上海市科技兴农重点攻关项目（2018-02-08-00-03-F01554）
