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作者：王萌;杨祎挺;甘麦邻;李永红;沈林園;朱砺;
单位：四川农业大学动物科技学院,农业农村部畜禽生物组学重点实验室;四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室;四川永鑫农牧集团股份有限公司;
摘要：伍隍猪是四川省资阳市伍隍区历史悠久的地方猪品种。本研究首次构建出伍隍猪线粒体基因组全序列，并进一步深入揭示了其mtDNA的结构和特点。研究结果表明，伍隍猪线粒体基因组序列全长为16 730 bp，碱基含量组成为A(34.64%)、T(25.80%)、G(13.36%)、C(26.20%)，总共包括13个蛋白编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码控制区（D-loop区）。22个tRNA中，除tRNASer(AGY)因缺少DHU臂外，其余tRNA均可以形成典型的三叶草结构。伍隍猪的D-loop区全长为1 294 bp，包括26个片段长度为10 bp的串联重复序列。基于ClustalW多序列比对分析发现，伍隍猪mtDNA序列和四川省6个地方猪的mtDNA序列之间的同源性达99.9%以上，其中共发现了9处主要的碱基突变位点。使用MEGA 11基于22个国内地方猪品种和国外引进品种的mtDNA序列构建系统进化树，结果发现四川省的4个地方猪品种（雅南猪、内江猪、成华猪、青峪猪）聚集成了一个枝簇，而伍隍猪分布于这一簇以外，这也在一定程度上揭示了伍隍猪mtDNA和四川本土地方猪mtDNA之间存在一定的差异。本研究结果为今后进一步开展伍隍猪种质资源的鉴定、开发、利用工作提供了重要的理论依据。
关键词：伍隍猪;线粒体基因组;非编码控制区;系统进化
基金资助：四川省科技计划（2021YFYZ0007、scsztd-2023-08-09）; 国家生猪产业技术体系（CARS-pig-35）; 国家生猪技术创新中心
