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作者：邓政;
单位：福建傲农生物科技集团股份有限公司,农业农村部华南生猪育种重点实验室;福建傲芯生物科技集团有限公司;
摘要：为鉴定与上杭槐猪总产仔数、产活仔数、产健仔数等繁殖性状相关的SNPs与候选基因，本试验通过中芯一号固相芯片与博瑞迪液相芯片对332头上杭槐猪进行了检测，并使用Beagle软件对合并后的基因型数据进行填充，使用R软件的SNPRelate包进行基因型数据质控，使用R软件的sommer包对总产仔数、产活仔数、产健仔数等繁殖性状进行校正，使用R软件的GAPIT包中的MLMM模型对上杭槐猪繁殖性状进行全基因组关联分析。研究发现，总产仔数有1个显著SNP位于16号染色体67 735 592 bp处；产活仔数有1个显著SNP位于16号染色体67 735 592 bp处；产健仔数共有2个显著SNPs位于2号染色体18 510 657 bp与16号染色体67735592bp处。在上述显著位点上下游200kb的区域内进行繁殖性状相关候选基因的挖掘，筛选到2号染色体上的HSD17B12基因与产健仔数有关，同时发现，在16号染色体67 735 592 bp处可能存在与上杭槐猪总产仔数、产活仔数、产健仔数等繁殖性状相关的潜在基因，有待进一步挖掘。本研究结果为后续通过分子育种手段加速上杭槐猪繁殖性能的选育提供了分子标记与技术支持。
关键词：上杭槐猪;总产仔数;产活仔数;产健仔数;全基因组关联分析
基金资助：福建省种业企业培优项目（2120814-农业生产发展支出）
