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中国畜牧杂志2024年第08期:猪肌内脂肪前体细胞成脂分化中mi RNA差异分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:张新雨;杨涛;吴俊静;乔木;徐忠;张宇;冯越;李梓芃;彭先文;梅书棋;李凤娥;周佳伟;

单位:动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北省农业科学院畜牧兽医研究所;华中农业大学农业农村部猪遗传育种重点实验室,农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室;

摘要:miRNA在成脂分化的过程中发挥着重要的调控作用,本研究旨在探究miRNA在猪肌内脂肪(Intramuscular Fat,IMF)前体细胞成脂分化过程中的表达模式,并对其潜在的调控功能进行分析。通过SmallRNA-seq、实时荧光定量PCR、miRanda、RNAhybird等技术和软件,对猪IMF前体细胞成脂诱导分化过程中miRNA的表达模式及靶基因进行了生物信息学分析。结果显示:猪IMF前体细胞诱导4 d后出现脂滴,在诱导0 d和4 d的猪IMF前体细胞中共鉴定到617个miRNAs,其中22个miRNAs诱导4 d表达显著上调,27个miRNAs表达下调;差异miRNAs共预测到13 869个靶基因,GO分析和KEGG分析发现靶基因主要富集到细胞分泌、细胞分解代谢、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等。此外,对miR-30家族的ssc-miR-30a-5p和ssc-miR-30c-3p进行定量验证,验证结果与测序结果一致。本研究揭示了miRNAs在猪IMF前体细胞成脂分化过程中的表达模式及潜在调控网络,为研究猪IMF沉积的调控机制奠定了前期基础。

关键词:猪;肌内脂肪;成脂分化;miRNA

基金资助:国家自然科学基金项目(32102527); 国家重点研发计划青年科学家项目(2022YFF1001300); 湖北洪山实验室重大项目(2021hszd003); 湖北省重点研发项目(2023BAA 02903); 国家生猪产业技术体系项目(CARS-36); 湖北省农业科技创新中心创新团队项目(2024-620-000-001-014)