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作者：赵乐乐;李何君;陆雪林;吴昊旻;薛云;徐忠惠;
单位：上海农林职业技术学院;上海市动物疫病预防控制中心;上海市崇明区种畜场;
摘要：为了保护和利用沙乌头猪种质资源，本研究选择现有8个家系的沙乌头猪，采用中芯一号50K SNP芯片对其进行了群体结构分析，结果表明，243头沙乌头猪个体的基因型检出率为95.66%～98.75%，平均值为98.39%；群体期望杂合度和观察杂合度分别为0.349和0.369。ROH分析结果显示，每个沙乌头猪个体含有的ROH数量为17～75个，个体的ROH总长度为110.94～581.52 Mb，其中41.56%个体的ROH总长度约300～400Mb；基于此得出沙乌头猪群体的平均近交系数为0.13。根据公猪聚类分析，将26头公猪大致划分为7个家系，并根据217头母猪与公猪间的亲缘关系，将它们划分入不同家系，其中3头母猪（个体号分别为7404、13506和13708）和检测群体中公猪亲缘关系都比较远，因此将其归类为其他。本研究基于中芯一号50K SNP芯片技术从遗传水平反映了沙乌头猪种群的群体结构，为沙乌头猪的保种、开发与利用提供了有力参考。
关键词：沙乌头猪;SNP芯片;保种;聚类分析;遗传多样性
基金资助：中青年教师领军人才培养计划（A6-02RS-23-28）; 上海市科技兴农重点攻关项目（2018-02-08-00-03-F01554）
