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作者：蔡晓钿;钟展明;魏趁;林清;徐志婷;吴细波;李加琪;张哲;
单位：华南农业大学动物科学学院,广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室,国家生猪种业工程技术研究中心;广西农垦永新畜牧集团有限公司;
摘要：研究旨在检测影响产仔数性状的基因组区域和候选基因，以期解析猪产仔数性状的遗传结构。以来自2个养殖场的8 938头大白猪为试验群体（基因分型个体1 173头），研究利用加权一步法全基因组关联分析（Weighted Single-step Genome-wide Association Study,wssGWAS）检测与1～5胎的总产仔数（Total NumberBorn,TNB）和产活仔数（TotalNumberBorn Alive,NBA）显著关联的基因组区域，并根据显著关联区域的物理位置进行候选基因注释及Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析。大白猪产仔数性状的遗传参数估计结果表明，TNB遗传力为0.11±0.01,NBA遗传力为0.08±0.01。研究共检测到16个显著关联大白猪产仔数性状的基因组窗口（窗口解释超过1%的遗传方差），这些显著的基因组窗口（0.4 Mb）分别解释了TNB和NBA约1.0%～2.4%和1%～3%的遗传方差。根据上述显著的基因组区域，研究共注释到49个性状候选关联基因（TRIB2、KCND3、DDX20和RAP1A等），其中部分基因已被报道与母猪的卵巢发育、激素分泌、乳头数等产仔数性状有关。通过GO和KEGG富集分析，共富集到3个GO通路。综上，本研究结果为解析猪产仔数性状的遗传结构提供了新的参考基因，为今后猪繁殖性能选育提供了重要依据。
关键词：大白猪;产仔数性状;加权一步法全基因组关联分析;候选基因;富集分析
基金资助：国家生猪现代农业产业技术体系（CARS-35）; 广西揭榜制科技项目（桂科JB23023003）
