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饲料研究2024年第04期:基于SNP分子标记的新疆野生黄花苜蓿遗传多样性分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:杜雨;于秀明;汪鹏;李倩;王玉祥;张博;

单位:新疆农业大学草业学院;

摘要:为揭示新疆野生黄花苜蓿的遗传多样性,研究利用SLAF-seq技术对材料进行SNP开发。结果显示,材料测序平均Q30值为96.32%,平均GC值为37.99%。研究共开发了376 641个SLAF标签,多态性SLAF标签119 331个;SNP平均完整性为24.77%,平均杂合率5.53%。供试新疆野生黄花苜蓿品系的有效等位基因数、观测等位基因数、期望杂合度、观测杂合度和Shnnon Wiener指数的平均值分别为1.380、1.594、0.220、0.117和0.327。研究表明,聚类分析将材料分为7类,PCA将材料分为3类,但样品的来源为同一个祖先。

关键词:黄花苜蓿;;SLAF-seq;;分子标记;;遗传多样性;;群体结构分析;;亲缘关系分析

基金资助:新疆维吾尔自治区重点研发任务专项计划“优质牧草高效生产与加工关键技术集成示范(项目编号:2022B02003)”;; 新疆维吾尔自治区科技重大专项“新疆农作物种质资源征集、评价与安全保存体系构建(项目编号:2022A03004-1)”;; 国家自然基金“新疆野生黄花苜蓿种质资源遗传特性与核心种质构建研究(项目编号:31860675)”