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作者：杨紫煦;苏畅;王波元;刘冲;李明贺;
单位：吉林大学口腔医院口腔颌面外科;吉林大学第二医院口腔科;
摘要：目的：筛选头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）差异预后乳酸代谢相关基因（LRGs），构建HNSCC的LRGs预后模型，并阐明其潜在的作用机制。方法 ：由癌症基因组图谱（TCGA）数据库和基因表达综合（GEO）数据库获取HNSCC基因表达及临床数据，由GeneCards数据库中获取LRGs，采用R软件筛选HNSCC的LRGs。采用单因素Cox回归分析得到预后相关基因，基于预后相关LRGs鉴定出2种不同亚型，采用Kaplan-Meier (K-M)曲线分析比较2组患者预后，采用CIBERSORT算法进行2组患者间的免疫相关分析。采用多因素Cox回归分析和LASSO回归分析构建预后模型，采用受试者工作特征曲线（ROC）和K-M生存曲线评估LRGs与HNSCC患者生存和预后的关系。采用GSE27020、GSE41613和GSE65858数据集验证预后模型。基于风险评分进行分组，并进行免疫相关分析和肿瘤相关评分分析。结果：通过TCGA数据库从HNSCC样本中差异分析筛选出1 196个LRGs，单因素Cox回归分析筛选出27个差异表达基因（DEGs）与HNSCC患者预后相关，根据预后相关基因鉴定出2种不同的LRGs亚型（分组1和分组2）,K-M生存曲线显示分组2患者总生存期（OS）明显高于分组1，分组2患者免疫细胞浸润水平明显高于分组1。多因素Cox回归分析和LASSO回归分析筛选出9个LRGs，包括次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶1 (HPRT1)、淀粉样蛋白前体蛋白（APP）、糖原磷酸化酶（PYGL）、尿激酶型纤溶酶原激活物（PLAU）、大麻素受体2(CNR2)、斯钙素2(STC2)、核苷酸结合寡聚化结构域样受体1 (NLRP1)、整合素连接激酶（ILK）和叉头框蛋白B1 (FOXB1)，构建预后模型，K-M曲线和ROC曲线显示上述9个基因表达水平与HNSCC患者生存和预后有关联，且均具有良好的1、 2和3年生存预测作用，ROC曲线下面积（AUC）均大于0.650，且预后模型的预后预测作用在GSE27020、GSE41613和GSE65858数据集中得到验证。根据风险评分分类的患者具有可区分的免疫状态。结论：基于生物信息学方法筛选出的HNSCC差异表达LRGs与HNSCC患者生存和预后有关联，由9个LRGs构建的预后模型可预测HNSCC患者的生存情况和治疗反应。
关键词：头颈部鳞状细胞癌;;乳酸代谢;;免疫浸润;;生物信息学;;LASSO回归分析
基金资助：吉林省财政厅科技项目（JCSZ2019378-13）
