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饲料研究2025年第12期:基于转录组测序对静原鸡肉质性状相关基因研究

来源:期刊VIP网 时间:


作者:罗琰;高博;刘盛楠;石福岳;郭海龙;杨永强;侯璐璐;

单位:甘肃省畜牧兽医研究所农业农村部畜禽资源(羊)评价利用重点实验室;静宁县畜牧兽医中心;武山县杨河镇农业农村综合服务中心;

摘要:试验通过对静原鸡不同类群胸肌组织进行转录组测序分析,探究静原鸡肉质性状的相关候选基因和信号通路。选择180日龄静原鸡4个类群健康母鸡各5只,采集胸肌组织。利用转录组测序(RNA-seq)技术筛选不同类群间的差异表达基因(DEGs),并对DEGs进行基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。随机挑选9个DEGs进行实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证。结果显示,试验共获得123个DEGs,其中上调基因40个,下调基因83个。显著富集的GO功能条目有64条,DEGs主要参与肌肉器官发育、横纹肌组织发育、肌肉组织发育、横纹肌细胞增殖和脂质修饰等。显著富集的KEGG信号通路有11个,DEGs主要富集在酪氨酸代谢、氧化磷酸化、甘油磷脂代谢和花生四烯酸代谢等信号通路中。9个DEGs的RT-qPCR结果与RNA-seq结果趋势一致。研究表明,前列腺素D合成酶、甘油磷酸胆碱磷酸二酯酶1、酪氨酸酶相关蛋白1、肌肉生长抑制素和肌动蛋白α心肌1是影响静原鸡肉质性状的重要候选基因;甘油磷脂代谢、酪氨酸代谢和花生四烯酸代谢信号通路可能参与了静原鸡肉质性状的调控。

关键词:静原鸡;;胸肌;;转录组测序;;差异表达基因

基金资助:甘肃省自然科学基金(项目编号:23JRRL0002);; 平凉市技术创新引导计划(项目编号:平科任[2021] 20号)