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作者:刘聪;毛春鹏;钟佑宏;陈银忠;
单位:大理大学临床医学院;昆明医科大学公共卫生学院;云南省地方病防治所(云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室)科教科;大理大学第一附属医院耳鼻咽喉科;
摘要:目的 分析多重耐药铜绿假单胞菌噬菌体YN02的生物学特性及全基因组特征,为院感防控及噬菌体临床应用奠定理论基础。方法 对气管切开术后肺部感染患者痰液样本分离出的菌株进行鉴定及抗菌药物敏感性试验,并以其为宿主菌,从医院污水中分离噬菌体。电镜观察其形态,测定其紫外、乙醇敏感性,酸碱和温度的耐受性、最佳感染复数和一步生长曲线,通过宿主谱实验评估其裂解范围。基于全基因组测序分析其基因组特征、功能注释及蛋白结构预测,构建系统发育树和平均核苷酸一致性热图,并进行比较基因组学分析。结果 分离得到1株多重耐药铜绿假单胞菌及其特异性噬菌体YN02,有约60nm头部和约301nm的尾部;紫外照射或>50%乙醇浓度作用30 min可使其失活;能在pH 2.0~12.0或4~50℃的环境中稳定存活;最佳感染复数(MOI)为0.000 01,潜伏期为70min,裂解量约50空斑形成单位(PFU)/细胞(cell),仅特异性裂解铜绿假单胞菌。基因组全长为93 989bp,GC含量为0.55。预测到128个开放阅读框(ORF),为萨姆纳病毒科(Samunavirus)的新成员,未发现抗菌药物耐药基因、毒力因子和溶原模块相关蛋白。结论 分离得到的YN02是一株对乙醇不耐受,耐高温及强酸强碱,宿主特异性强的噬菌体,为多重耐药铜绿假单胞菌的噬菌体疗法和防治提供科学依据。
关键词:噬菌体疗法;;多重耐药铜绿假单胞菌;;基因组特征分析;;噬菌体生物控制;;抗菌药物耐药性
基金资助:云南省科技厅科技计划项目(202305AD160011)