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作者：张若彤;汪家骏;陈若楠;杨朝永;孙楠桢;董伟;孙杰;
单位：石河子大学动物科技学院;新疆诺奇拜城油鸡发展有限公司;
摘要：肌纤维的分化直接影响肌肉类型。本研究旨在筛选肌肉中差异表达的长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)和小RNA(microRNA, miRNA)，构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。试验利用玫瑰冠鸡和科宝鸡胚胎期肌肉组织建立lncRNA、miRNA文库，筛选与肌纤维分化相关的胚胎期骨骼肌差异表达的lncRNA和miRNA，进行靶向关系预测、GO和KEGG富集分析并构建lncRNA相关的ceRNA调控网络。结果显示，共有953个lncRNA和909个miRNA在胚胎期8 d和14 d组间差异表达。基于靶向关系预测、靶基因功能富集分析，筛选出与肌纤维分化相关的lncRNA和miRNA，成功构建包含41个lncRNAmiRNA-mRNA关系对的lncRNA相关ceRNA网络。研究结果为丰富后续ceRNA在肌纤维分化的研究提供理论依据，为改善家禽肌肉品质奠定了基础。
关键词：鸡;胚胎期;miRNA;lncRNA;肌纤维分化;ceRNA
基金资助：国家自然科学基金（31860641）
