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作者:李晋任;索郎纳甲;赵志礼;米玛卓嘎;尕让甲;倪梁红;
单位:上海中医药大学中药学院;西藏自治区拉萨市林周县人民医院唐古乡分院;西藏自治区藏医院;
摘要:目的 测定毛莲蒿Artemisia vestita Wall. ex Bess.叶绿体基因组序列。方法 基于民族植物学考察,采集样品并进行原植物鉴定;采用Illumina高通量测序平台进行叶绿体基因组测序,相关软件组装序列、注释及结构分析;与蒿属6个近缘物种进行叶绿体基因组进行比较分析;以桔梗科植物毛细钟花Leptocodon hirsutus D. Y. Hong为外类群,基于毛莲蒿与菊科其他32个分类群的叶绿体基因组序列构建ML系统发育树。结果 毛莲蒿叶绿体基因组大小为151 204 bp,总GC含量为36.88%;大单拷贝区、小单拷贝区长度分别为82 949、18 331 bp,反向重复区长度为24 962 bp;共编码134个基因,包括89个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和37个tRNA基因。基因组中共检测到67个简单重复序列SSRs和44个长重复序列LSRs。与蒿属近缘物种比较,筛选到3个基因高突变区(clpP、rpl36、ycf1)和6个基因间区高突变区(trnK-UUU-matK、rps18-rpl20、rpl36-infA、rpl14-rpl16、rpl16-rpl3、trnL-UAG-ccsA),可作为蒿属物种鉴定的候选DNA条形码序列;系统发育分析显示,蒿属形成一个高度支持的单系群,毛莲蒿与白莲蒿A.gmelinii Web. ex Stechm.的亲缘关系最近。结论 本研究可为蒿属植物系统发育分析、藏药基原植物鉴定及物种DNA条形码构建等提供基础资料。
关键词:毛莲蒿;;藏药;;叶绿体基因组;;系统发育分析;;物种鉴定
基金资助:国家自然科学基金面上项目(82073959);; 2020年度西藏自治区藏医药管理局局级科技计划项目(JJKT2020017)