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作者:张曦元;孙千荟;孙丹丹;侯卓成;
单位:中国农业大学动物科学技术学院;
摘要:圆盘大MAGUK支架蛋白5(Discs Large MAGUK Scaffold Protein 5,DLG5)参与上皮细胞极性维持、肌肉发育和癌症发展等生理过程,但在禽类中的研究尚未深入。本研究旨在鉴定北京鸭DLG5基因的核心启动子区域并探究其多态性对于转录活性的影响,为探究该基因的功能和表达调控机制提供依据。构建含北京鸭DLG5基因启动子区缺失序列的双荧光素酶缺失载体,开展双荧光素酶报告试验,鉴定其核心启动子区域;获取北京鸭DLG5基因核心启动子区域的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点信息,构建双荧光素酶突变载体,开展双荧光素酶报告试验,探究其多态性对转录活性的影响;使用生物信息学方法分析北京鸭DLG5基因启动子区的序列特征和转录因子结合位点。结果表明,北京鸭DLG5基因的-1 298~-868 bp区域为负调控区域,-868~-431 bp和-431~-191 bp区域为正调控区域,-868~+124 bp区域是核心启动子区域。此外,-448 bp G>C突变可显著增强启动子活性(P<0.05),-365 bp C>G突变可显著降低启动子活性(P<0.05)。生物信息学分析表明,北京鸭DLG5基因的核心启动子区域内有多个转录因子结合位点,包括TEAD4、MyoD、MyoG、C/EBPalpha、C/EBPbeta、AP-1、NF-1、SP1、ZBTB42、KLF15、KLF5等。此外,-448 bp G>C突变可能导致C/EBPbeta转录因子结合位点丢失,并生成NF-1转录因子结合位点,-365 bp C>G突变可能导致MyoG转录因子结合位点丢失,并生成SP1和Msx-1转录因子结合位点。系统进化树分析表明,北京鸭DLG5基因与鸿雁DLG5基因亲缘关系最近。本研究鉴定了北京鸭DLG5基因的核心启动子区域,并探究了其多态性对转录活性的影响,为后续探究该基因的功能和表达调控机制提供了理论依据。
关键词:DLG5;;启动子;;SNP;;转录因子;;北京鸭
基金资助:国家现代水禽产业技术体系(CARS-41)