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作者：张建永;邢岗;杨凯;袁媛;彭忠宏;郭永峰;朱俊儒;阴浩;安小鹏;
单位：陕西乾县动物疫病预防控制中心;陕西泾阳县畜牧产业服务中心;陕西乾县农业农村局;空军军医大学基础医学院病理学教研室;陕西安康畜牧兽医中心;河北黄骅农业农村局;西北农林科技大学动物科技学院;
摘要：为获得关中奶山羊半胱天冬酶-3(Caspase-3)基因CDS区，探究其生物信息学功能及其在关中奶山羊不同组织的表达规律，本研究以关中奶山羊乳腺组织cDNA为模板，通过PCR技术克隆Caspase-3基因的CDS区，并对其进行测序。在此基础上，对其进行生物信息学分析，实时荧光定量PCR检测Caspase-3基因在关中奶山羊乳腺、心脏、肾脏、子宫、脾脏、肝脏组织中的表达情况。结果显示：关中奶山羊的Caspase-3基因CDS区全长828 bp，编码275个氨基酸。氨基酸相似性比对结果显示，关中奶山羊Caspase-3基因与绵羊、羚牛、水牛、家牛、黇鹿、猪、双峰驼、人、小鼠的相似性分别为99.6%、98.5%、95.3%、94.5%、90.5%、88.4%、86.5%、83.6%、81.8%。系统进化树显示，关中奶山羊Caspase-3基因与绵羊、羚牛的亲缘关系更近，与双峰驼、猪、人、小鼠亲缘关系较远。关中奶山羊Caspase-3蛋白分子式为C_(1361)H_(2144)N_(362)O_(426)S_(21)，属于稳定蛋白、亲水性蛋白，不含跨膜螺旋结构和信号肽，其主要定位于细胞核中。实时荧光定量PCR结果显示，Caspase-3基因在关中奶山羊各组织中均有一定程度的表达，其中在子宫和脾脏中的表达量显著高于其他组织。本研究为进一步阐释关中奶山羊Caspase-3基因功能奠定了基础。
关键词：关中奶山羊;;Caspase-3;;生物信息学分析;;组织表达谱
基金资助：陕西省重点研发计划（2024NC-ZDCYL-03-01、2024NC-YBXM-082、2024NC-GJHX-22）;; 奶山羊基因组液相芯片的研究及应用（QY-HS-2024A-01）;; 陕西省中央引导地方科技发展专项资金（2024ZY-CGZY-20和2024ZY-CGZY-22）
