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中国畜牧杂志2025年第09期:猪miR-148a-3p的生物信息学分析与靶基因验证

来源:期刊VIP网 时间:


作者:齐婧;谭娅;裴国海;张静;龙建华;赵春萍;杜春林;王婧;田景红;史开志;

单位:贵州省农业科学院畜牧兽医研究所;松桃苗族自治县农业农村局;贵阳市乌当区新场镇农业综合服务中心;松桃苗族自治县健达动物防疫专业合作社联合社;

摘要:miR-148a-3p是前期课题组通过转录组测序发现的在猪卵巢组织中高表达的小RNA(microRNAs,miRNAs)之一,为探究miR-148a-3p对猪繁殖性状的调控作用,本研究围绕miR-148a-3p序列开展进化分析、靶基因预测及功能富集分析、组织表达分析,并通过双荧光素酶报告系统验证靶标关系。结果表明,各物种miR-148a-3p的第2~8位碱基完全一致,猪miR-148a-3p与人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)和猕猴(Macaca mulatta)亲缘关系较近;对miR-148a-3p靶基因进行GO和KEGG功能富集分析发现,miR-148a-3p的靶基因可富集到子宫内胚胎发育、正向调控转移酶活性、酶联受体蛋白信号通路、PI3K-Akt、TGF-β和MAPK信号通路等与动物繁殖相关的信号通路中。miR-148a-3p可与PRLR基因的CDS区域结合。RT-qPCR结果显示,miR-148a-3p在保育猪卵巢组织中的表达量最高且极显著高于其他组织,且在黄体期的卵巢组织中,miR-148a-3p和PRLR的表达量呈负相关趋势。双荧光素酶报告系统结果显示,超表达miR-148a-3p能显著抑制PRLR野生型载体的荧光活性。综上,miR-148a-3p与PRLR存在靶向关系,且可靶向PRLR-CDS区域,为进一步探究miR-148a-3p调控繁殖性状的分子机制提供了依据。

关键词:柯乐猪;;miR-148a-3p;;PRLR;;卵巢;;繁殖性状

基金资助:贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2023]一般076;黔科合支撑[2022]重点032);; 黔农科院青年基金[2022]23号;; 黔农科青年基金[2023]03号;; 贵州省生猪产业技术体系建设(GZSZCYJSTX-02)