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中国畜牧杂志2025年第09期:从江香猪不同组织内参基因筛选及稳定性分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:龙菊烟;田姣;王嫱;牛熙;黄世会;冉雪琴;王嘉福;

单位:贵州大学生命科学学院,农业生物工程研究院,山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室;贵州省农业生物工程重点实验室;喀斯特山区植物资源利用与育种国家地方联合工程研究中心(贵州);贵州大学动物科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室;

摘要:为筛选从江香猪不同组织定量逆转录PCR(Quantitative Reverse Transcription PCR,RT-qPCR)中转录水平最适内参基因,本文利用RT-qPCR检测β-肌动蛋白(β-actin,ACTB)、β-2-微球蛋白(Beta-2-Microglobulin,B2M)、甘油醛三磷酸脱氢酶(Giyceral-dehyde-3-phosphate Dehydrogenase,GAPDH)、核糖体蛋白L4(Ribosmal Protein L4,RPL4)、肽基脯氨酰异构酶A(Peptidylprolyl Isomerase A,PPIA)、琥珀酸脱氢酶亚基A(Succinate Dehydrogenase Complex Flavoprotein Subunit A,SDHA)、TATA盒结合蛋白(TATA-box Binding Protein,TBP)、酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单氧化酶激活蛋白zeta多肽(Tyrosine3-monooxygenase/Tryptophan 5-monooxygenase Activation Protein Zeta Polypeptide,YWHAZ)8个常用内参基因在从江香猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏中的转录水平,采用ΔCt、geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder 5个算法分析候选内参基因表达稳定性,以筛选出在从江香猪不同组织中最适的内参基因。综合分析5个算法结果,结果显示,B2M和GAPDH是心脏最适内参基因;RPL4和SDHA是肝脏最适内参基因;PPIA和SDHA是脾脏最适内参基因;ACTB和SDHA是肺脏最适内参基因;YWHAZ和PPIA是肾脏最适内参基因。由此可见,这些常用的内参基因的转录水平稳定性在不同组织中存在一定的差异。本研究结果可为后续从江香猪基因表达研究提供理论参考。

关键词:从江香猪;;RT-qPCR;;内参基因;;表达稳定性

基金资助:贵州省普通高等学校青年人才成长项目(黔教合字[2022]152号);; 贵州大学引进人才科研项目(贵大人基合字[2023]43号);; 国家自然科学基金(32360810、31960641);; 贵州省科技创新人才团队项目(黔科合平台人才[2019]5615);; 贵州省“百”层次创新型人才培养项目(黔科合人才[2016]4012)