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作者：魏稚彤;高攀;高腾云;祁兴磊;王二耀;张子敬;刘贤;梁栋;付彤;
单位：河南农业大学动物科技学院;泌阳县农业综合行政执法大队中心;泌阳县畜牧技术服务中心;河南省农业科学院畜牧兽医研究所;河南省畜牧总站;
摘要：为了解信阳水牛的种质资源现状，本研究利用全基因组重测序技术，对30头信阳水牛基因组遗传多样性、群体遗传结构和连续纯合片段（Runs of Homozygosity,ROH）等指标进行分析，评估其保种效果。结果如下：信阳水牛遗传多样性丰富，最小等位基因频率为0.195，平均多态信息含量为0.277，平均期望杂合度为0.280，平均观察杂合度为0.269，平均核苷酸多样性为2.586。家系分析将30头信阳水牛分为6个家系；30头信阳水牛个体共检测到3578个ROH，长度在0～0.5Mb的ROH片段占比最多，基于ROH值计算的群体近交系数范围介于0.000 4～0.091 9，平均近交系数为0.020 1。综上，信阳水牛群体遗传多样性较为丰富，整体上保持了较低的近交水平，保种效果良好，建议后续适当引入新血缘与少数高近交水平个体交配。
关键词：信阳水牛;全基因组重测序;遗传多样性;ROH
基金资助：国家自然科学基金青年项目（32202636）; 河南省重大科技专项（221100110200）; 河南省肉牛产业技术体系HARS-22-13-T
