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作者：汪林丽;朱亚宁;艾越;张效生;韩红兵;
单位：禽畜遗传改良北京市重点实验室,中国农业大学动物科学技术学院;农业与农村部动物遗传育种与繁育重点实验室,中国农业大学动物科学技术学院;天津市畜禽分子育种与生物技术重点实验室;
摘要：本研究旨在探究TNC(Tenascin-C)基因敲除对绵羊子宫内膜上皮细胞（Endometrial Epithelial Cells,EECs）迁移功能的影响及其内在信号通路，为研究胚胎附植及改善子宫内膜容受性提供借鉴。在TNC外显子3和5设计和筛选高活性sgRNA，转染绵羊EECs后，通过PCR和RT-PCR鉴定出TNC 6.1 kb片段缺失的绵羊EECs，即plate 1-G3和plate 2-B5。通过划痕实验检测plate 1-G3和plate 2-B5迁移功能变化，并通过RNA-seq和生物信息学分析筛选共差异表达基因（co-Differentially Expressed Genes,co-DEGs），进行GO分析、KEGG分析以及PPI分析。结果表明，TNC基因敲除促进了绵羊EECs的迁移，通过RNAseq和生物信息学分析筛选出2326个co-DEGs，包括1304个上调co-DEGs和1022个下调co-DEGs。GO分析显示，co-DEGs富集到细胞迁移、粘附、细胞-底物连接等。KEGG分析显示，co-DEGs富集在PI3KAkt信号通路、ECM-受体相互作用、Rap1信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性等。GO条目中225个迁移相关co-DEGs的KEGG分析也富集到类似信号通路。迁移相关DEGs的PPI分析显示，中心枢纽基因有PIK3R3、FN1、FGFR1、ITGB3、PDGFRA等。TNC基因敲除导致绵羊EECs的迁移功能增强并揭示了其相关通路和关键基因，为研究胚胎附植及改善子宫内膜容受性提供了新思路。
关键词：TNC;子宫内膜上皮细胞;RNA-seq;细胞迁移;功能富集分析
基金资助：国家自然科学基金（31672418）
