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作者：刘琛;何永江;豆腾飞;杨明华;潘洪彬;赵素梅;李永能;黄英;
单位：云南农业大学动物科学技术学院/云南省动物营养与饲料重点实验室;云南农业大学组织部;
摘要：本研究旨在克隆茶花鸡2号α干扰素基因（IFN-α）CDS区序列并进行生物信息学分析，为后续研究IFN-α基因对茶花鸡2号免疫功能的影响提供参考。以茶花鸡2号为实验对象设计IFN-α引物，提取总RNA，反转录PCR扩增并克隆其编码区序列，进行生物信息学分析。结果显示茶花鸡2号IFN-α基因CDS序列全长582 bp,IFN-α蛋白等电点5.05，平均疏水指数-0.514，为酸性亲水蛋白，且存在信号肽和1个跨膜区，主要定位于细胞核。IFN-α蛋白被4个N糖基化位点、5个O糖基化位点和20个磷酸化位点修饰，主要由α-螺旋与无规卷曲构成。茶花鸡2号与固始鸡、海兰鸡、惠阳胡须鸡、罗曼鸡和乌骨鸡的氨基酸同源性分别为95.9%、97.9%、97.9%、97.9%和95.9%。IFN-α蛋白与IRF7、IFNAR1、IFNAR2和IFNK等蛋白存在互作关系。本研究结果可为进一步探讨IFN-α基因在茶花鸡2号病毒疾病防治中的作用提供理论依据。
关键词：茶花鸡2号;IFN-α基因;基因克隆;生物信息学分析
基金资助：云南省动物营养与饲料重点实验室开放基金（2021YNPKLANF005）; 国家蛋鸡产业技术体系昆明综合试验站（CARS-40-S25）; 云南省教育厅科学研究基金项目（2022J0291）
