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中国畜牧杂志2024年第01期:奶山羊低密度液相SNP芯片开发及有效性验证

来源:期刊VIP网 时间:


作者:程明;孙军昌;曹欣欣;戴正浩;王琦;娄兰强;李和刚;

单位:青岛市畜牧兽医研究所;青岛市即墨区畜牧业发展服务中心;青岛农业大学动物科技学院;

摘要:为更好地了解奶山羊在世代更替中的遗传谱系,避免因错误谱系记录造成群体近交程度过高,本研究利用液相SNP芯片标记技术确立羊群遗传谱系及其亲缘关系。通过简化基因组测序,对25个不同种群的崂山奶山羊基因组DNA样本进行分析,挑选出1 792个SNP多态性位点,再通过靶向测序基因型分型,合成低通量的探针,最后对探针进行相应的捕获测试,开发出检测崂山奶山羊遗传基因的低密度液相SNP芯片。将该液相芯片应用于300只崂山奶山羊群体的血缘关系鉴定,与已知300只奶山羊系谱记录的亲缘关系进行对比,发现结果高度吻合,证明此芯片具有很高的准确性。本实验开发出均一性高、位点多态性好的低密度液相芯片技术,可专门用于崂山奶山羊亲缘关系鉴定,从而更好地指导奶山羊的选种选配。

关键词:奶山羊;液相SNP芯片;杂交捕获测序;亲缘鉴定

基金资助:青岛民生市科技计划(21-1-4-ny-8-nsh); 山东省农业产业技术体系(SDAIT-10-03)