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中华医院感染学杂志2025年第14期:基于全基因组测序的ICU环境中金黄色葡萄球菌耐药性及其基因特征

来源:期刊VIP网 时间:


作者:梁艳茹;杨博雯;张悦;许统圣;赵冰;王筱;

单位:上海市浦东新区疾病预防控制中心;复旦大学浦东预防医学研究院;

摘要:目的 了解上海市浦东新区部分医院重症加强护理病房(ICU)环境中金黄色葡萄球菌(SA)的分布、耐药及分子特征,为感染防控提供依据。方法 选取2019年及2023年浦东地区8所医疗机构ICU环境样本进行SA的分离及鉴定。通过微量肉汤稀释法进行药敏试验,基于毒力基因数据库、耐药基因数据库和PubMLST等数据库预测耐药、毒力基因,进行多位点序列分型(MLST)及系统发育分析。结果 共采集样本3 408份,SA检出率为1.29%(44/3 408),其中共用物品和医护人员直接接触物品检出菌株占比最高,均为20.45%(9/44);耐甲氧西林SA(MRSA)菌株占比25.00%,多重耐药率为40.91%。对青霉素耐药率最高(72.73%,32/44),对万古霉素、利福平、磺胺甲噁唑/甲氧苄啶、达托霉素和呋喃妥因完全敏感。共携带9类26种耐药基因,氟喹诺酮类耐药基因norA携带率为100.00%;携带12种肠毒素基因,其中sea基因携带率最高(50.00%,22/44),部分菌株携带lukS-PV、lukF-PV及tsst基因;有14种序列(ST)型,以ST7为主(13/44,29.55%),发现新ST型ST9342。系统发育将所有菌株分为2大分支,相同ST型菌株在进化树上距离较近。结论 SA存在于ICU环境中,耐药现况严峻,ST型别丰富,且与致病性存在一定相关性。

关键词:重症加强护理病房环境;;金黄色葡萄球菌;;耐药性;;系统发育;;耐药基因;;毒力基因

基金资助:上海市加强公共卫生体系建设三年行动计划(2023-2025年)重点学科基金资助项目(GWVI-11.1-02);; 上海市浦东新区科技和经济委员会基金资助项目(PKJ2024-Y78)