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作者:肖梦怡;韩振志;路环环;丛如意;冀天娇;祝双利;孙强;刘莹;周蕾;栗凡;梁钰材;范华;肖金波;张勇;
单位:山东第一医科大学(山东省医学科学院),公共卫生与健康管理学院;国家脊髓灰质炎实验室,世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室,国家卫生健康委员会生物安全重点实验室;首都儿科研究所病毒学研究室,儿童病毒病病原学北京市重点实验室;中国人民解放军疾病预防控制中心;华北理工大学,公共卫生学院;沈阳医学院;山东第二医科大学基础医学院;
摘要:自2014年肠道病毒D组68型(Enterovirus D68,EV-D68)引起急性弛缓性脊髓炎暴发以来,一直被广泛关注。建立一种快速、高效且便捷的EV-D68特异性Real-time RT-PCR检测方法,对于及时发现潜在的传染源并迅速阻断传播至关重要。本研究参考EV-D68各个基因型VP1区代表序列设计探针和引物,通过制作标准品,对其特异性、灵敏度以及重复性进行全面评价,并用临床样本检测其可靠性。结果显示,本研究所设计的探针和引物仅能检出EV-D68,其他73种血清型肠道病毒均无检出情况,最低检测下限为2×10~1拷贝/μL,拷贝数与循环阈值之间具有良好的线性关系(R~2=0.9933),重复性检测的变异系数小于1.70%,稳定性良好。采用本研究设计的探针和引物对41份临床样本进行检测时,实现了零漏检,与测序的金标准结果完全吻合,对于目前流行的B3和D3基因亚型可以实现全覆盖。综上所述,本研究设计的特异性探针引物在EV-D68检测中展现出高效且准确的特性,同时对目前流行的基因型具有较强的通用性,能够为EV-D68感染的临床诊断、疫情监测以及流行病学调查工作提供有力支持,为EV-D68的快速鉴定和相关疾病防控提供关键技术支撑。
关键词:肠道病毒D组68型;;实时荧光定量RT-PCR;;特异性;;灵敏度;;重复性
基金资助:公共卫生人才培养支持项目(项目号:GJJKJ-2024-ZY)~~