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作者:唐佳婕;贾永涛;王玲琳;童肖翔;应潇锋;董长征;
单位:宁波大学医学部公共卫生学院;嘉兴市疾病预防控制中心;
摘要:深度突变扫描(Deep mutational scanning,DMS)是近年发展的一种高通量的评估病毒变异风险的前沿生物技术方法。DMS通过人工突变产生海量的病毒变异体模拟病毒潜在的变异,同时测定变异体的重要表型如受体结合亲和力、免疫逃逸、适应性和耐药性等,评估变异对表型的影响及其风险。DMS需要综合运用病毒突变文库构建、病毒表型测定和深度测序等多种高通量平台,对于平台技术的要求极高。新冠病毒疫情期间,DMS被广泛应用于评估病毒变异对受体结合力和免疫逃逸等表型的影响,全方位地展示了其在表型预测和变异风险评估中的重要作用。本文对DMS在新冠病毒、肠道病毒、流感病毒和HIV等代表性RNA病毒研究中的应用进行综述,帮助认识DMS在RNA病毒变异风险评估中的广阔应用前景。
关键词:深度突变扫描(DMS);;病毒变异风险;;深度测序;;适应性;;免疫逃逸;;受体结合亲和力
基金资助:宁波市公益类科技计划(项目号:2021S135),题目:基于生物信息学的人肠道病毒基因组监测和风险评估技术研究;; 宁波市自然科学基金项目(项目号:2024J314),题目:基于饱和突变扫描和深度突变扫描的人肠道病毒基因组变异风险评估~~