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作者：唐红萍;姚美华;曹利华;史庆丰;
单位：启东市人民医院/南通大学附属启东医院院长室;启东市人民医院/南通大学附属启东医院感染管理科;复旦大学附属中山医院感染管理科;复旦大学医院感染与控制研究所;
摘要：随着多重耐药菌在临床的广泛流行，医院感染防控面临严峻挑战。全基因组测序(WGS)和宏基因组二代测序(mNGS)等新型基因测序技术通过高分辨率基因组分析，为医院感染暴发的精准溯源和相关防控提供了技术支持。本文系统综述了WGS和mNGS的技术原理及优势，并通过国内外典型案例分析，详细阐述了这些技术在暴发确认、感染源识别、传播链重建、传播动力学研究及感染防控效果评价中的核心作用，以期为今后医院感染防控的精准识别和防控提供理论和技术支持。
关键词：全基因组测序;;医院感染;;感染暴发;;分子溯源;;宏基因组二代测序
基金资助：美国中华医学基金会基金资助项目(Grant#23-513);; 江苏省医院协会医院管理创新研究基金资助项目(JSYGY-3-2023-531);; 上海申康医院发展中心第三批诊疗技术推广基金资助项目(SHDC22022220);; 复旦大学附属中山医院发展基金资助项目(2021ZSFZ14)
